Genexus 純化系統(tǒng)可提供:
•MagMAX 技術(shù)—得出一致的萃取結(jié)果
• 預(yù)填充的耗材—有助于縮短手動處理時間
• 可視化系統(tǒng)—運行設(shè)置期間可提供有關(guān)耗材的實時反饋,以防止設(shè)置錯誤
• 集成的核酸定量分析—縮短運行后處理時間
Genexus 純化系統(tǒng)在 Genexus 集成測序儀上使用時,可實現(xiàn)多種組織類型的自動化核酸萃取和定量分析。該純化系統(tǒng)具有單個觸點和 10 分鐘的手動操作時間,可從 FFPE 裂解物中按順序提取 DNA 和 RNA,從血漿中提取 cfTNA,以及從全血、新鮮或冷凍組織、骨髓或外周血白細(xì)胞中單獨提取 DNA 或 RNA。Genexus 軟件連接至集成測序儀后,可集成從設(shè)置到報告的工作流程至單個軟件生態(tài)系統(tǒng)中,實現(xiàn)下一代測序 (NGS) 工作流程的簡化。
預(yù)填充試劑
Genexus 純化系統(tǒng)耗材預(yù)填充有執(zhí)行萃取所必需的大多數(shù)試劑,因此每份樣品僅需很少的移液步驟即可設(shè)置運行。只需移除箔封,添加酶和您的樣品,然后將耗材放置在儀器上。
可視化系統(tǒng)
就像 Genexus 集成測序儀,Genexus 純化系統(tǒng)使用機載可視化系統(tǒng)來驗證試劑的放置并實時檢測錯誤。可視化系統(tǒng)持續(xù)檢查耗材是否適合純化運行類型,并有助于防止使用已過期或之前已用過的耗材。在系統(tǒng)基座中的屏幕上會顯示有關(guān)系統(tǒng)中加載耗材的反饋。
MagMAX 技術(shù)
MagMAX 技術(shù)使用磁珠執(zhí)行核酸萃取。MagMAX 磁珠因其較大的表面積可提供出色的結(jié)合性能,接受更大范圍的不同粘度樣品,并且允許小容量樣品的高效洗脫。
48‐孔核酸儲存板
萃取后,所有核酸直接轉(zhuǎn)移至 48‐孔儲存板并在運行完成后長達(dá)一小時的時間內(nèi)保持冷卻。48‐孔核酸儲存板帶有條形碼,便于在多個存儲的儲存板中追蹤樣品提取。
自動化定量分析
Genexus 純化系統(tǒng)可使用 Genexus 集成測序儀實現(xiàn)萃取核酸的自動化定量分析。兩種染料用于檢測提取樣品中的 DNA 或 RNA 濃度。自動化的運行后定量分析可節(jié)省手動操作時間,允許在運行完成后直接使用萃取樣品進(jìn)行基因分析工作流程。
快速周轉(zhuǎn)
Genexus 純化系統(tǒng)的運行時間從 2 到 5.5 個小時不等,具體取決于萃取樣品的數(shù)量和正在運行的方案。自動化定量分析有助于顯著減少運行后的手動操作時間,從而快速過渡到后續(xù)的基因分析工作流程。
運行后清潔
每次運行后,研究人員會丟棄接觸樣本的所有耗材,然后 Genexus 純化系統(tǒng)會使用紫外光來清潔工作臺。自動化紫外光清潔可防止可能的運行間核酸殘留,這種殘留可能導(dǎo)致下游測序污染。
額外的工作流程益處
Genexus 純化系統(tǒng)是 Ion Torrent Genexus 系統(tǒng)的組成部分,該系統(tǒng)是個整體 NGS 解決方案,可自動完成從標(biāo)本到報告的工作流程,并可在一天內(nèi)得出結(jié)果。當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)連接到 Genexus 集成測序儀后,額外的工作流程益處包括:
Genexus 軟件—Genexus 集成測序儀的軟件用于計劃從標(biāo)本到報告的完整工作流程。研究人員使用該軟件選擇 NGS 測定并分配待運行的樣本。該軟件可從純化到測序和運行后樣品報告全程追蹤樣本。
NGS 即用型測序板—當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)連接到 Genexus 集成測序儀并作為集成工作流程的一環(huán)運行時,每種萃取核酸的預(yù)定義等分試樣會從儲存板轉(zhuǎn)移到 NGS 即用型 96 孔核酸測序板,該板可用作樣本輸入至 Genexus 集成測序儀。
查看濃度—當(dāng) Genexus 凈化系統(tǒng)與 Genexus 集成測序儀配對使用并作為集成工作流程的一環(huán)運行時,萃取核酸濃度會傳輸給 Genexus 軟件??梢栽O(shè)置測定特異性核酸濃度閾值,以篩選哪些樣品進(jìn)行測序,或者在繼續(xù)操作之前可以手動檢查提取輸出。核酸濃度檢查可防止浪費用于數(shù)量不足樣品的測序試劑。
免移液轉(zhuǎn)移至 Genexus 集成測序儀—當(dāng) Genexus 純化系統(tǒng)與 Genexus 集成測序儀連接并作為集成工作流程的一環(huán)運行時,萃取后核酸濃度會發(fā)送給集成測序儀的 Genexus 軟件。NGS 即用型輸出板免移液轉(zhuǎn)移至集成測序儀,因為所提供的核酸濃度允許測序儀將核酸稀釋至測序工作流程的測定特定輸入量。